既然益生菌有用，那吃什麼產品才好？吃乳酪有用嗎？雖然乳酪是發酵食品，含益生菌，但活性如何是未知之數。

在美國，乳酪生產商可進行「發酵後加熱處理」，此舉會殺死產品內大多數微生物。雖然政府部門會檢驗乳酪包裝時的活性微生物含量，每克超過108乳酸菌才會發認證，但作為發酵原材料的細菌也計算其中，它們不是益菌，吃了沒用。由藥廠製造的益生菌製劑，所含的活性益菌數量就有保證多了。

不同菌種的功效有不同的科學實證，對我們選擇產品有一些提示。洛德乳酸菌(Lactobacillus reuteri) 有超過50份臨床報告支持，是最多臨床實證支持的菌種，科研發現它能改善嬰兒腸胃炎肚瀉、腸絞痛及預防濕疹。改善成人胃氣及消化不良、偶發性便秘或肚瀉、乳糖不耐、服用抗生素後的不適等。

雷諾氏乳酸菌(Lactobacillus rhamnosus) 及嗜酸乳酸桿菌 (Lactobacillus acidophilus) 也有科學實證支持其減低小兒肚瀉的功效。製劑方面，除了傳統膠囊及粉末外，個別品牌的益菌製劑採用咀嚼片方式，不會被胃酸、膽汁殺死，活性令人滿意；亦有臨床數據證明孕婦及初生嬰兒都可服食，安全性高。